Главная → Архив → 2025 год, выпуск №2 → Клиническая польза от назначения комплексного геномного профилирования в смешанной когорте пациентов с распространенными солидными опухолями: предиктивная модель

Клиническая польза от назначения комплексного геномного профилирования в смешанной когорте пациентов с распространенными солидными опухолями: предиктивная модель

П.С. Шило1, 2 *, М.Л. Макаркина3, Н.С. Хвастушин4, А.А. Захаренко1
________________________________________________________________________________________________________

1 Первый Санкт-Петербургский государственный медицинский университет имени академика И.П. Павлова,
Санкт-Петербург, Российская Федерация;
2 Клиника «Лахта», Санкт-Петербург, Российская Федерация;
3 Санкт-Петербургский клинический научно-практический центр специализированных видов медицинской помощи (онкологический) имени Н.П. Напалкова, Санкт-Петербург, Российская Федерация;
4 Московская городская онкологическая больница № 62, Москва, Российская Федерация
________________________________________________________________________________________________________

Введение. Несмотря на достижения в области онкологии, метастатические формы солидных опухолей по-прежнему характеризуются неблагоприятным прогнозом. Одним из перспективных подходов для персонализации лечения является комплексное геномное профилирование (КГП), позволяющее выявлять молекулярные мишени и подбирать таргетную терапию. Однако эффективность КГП в реальной клинической практике остаётся предметом дискуссий, особенно в смешанных когортах и при ограниченных ресурсах.

Цель. Оценить клиническую пользу от назначения КГП у пациентов с распространёнными солидными опухолями различных нозологий и разработать предиктивную модель для прогнозирования эффективности данного подхода.

Материалы и методы. В ретроспективное исследование было включено 169 пациентов с метастатическими формами солидных опухолей, которым в 2019–2024 гг. выполнялось КГП методом таргетного секвенирования с использованием коммерческих панелей (≥350 генов). Анализ включал сравнение групп с выполненным КГП и без КГП по показателям отношения времени до прогрессирования после двух последовательных линий терапии (PFS2/PFS1) и медиане выживаемости без прогрессирования (PFS). Построена предиктивная модель на основе клинических и молекулярных факторов.

Результаты. При раке молочной железы и немелкоклеточном раке лёгкого назначение КГП ассоциировалось со статистически значимым увеличением доли пациентов с PFS2/PFS1 >1,3 (p=0,039) и улучшением медианы PFS (p <0,05). В группах с колоректальным раком, раком желудка и раком поджелудочной железы подобной зависимости выявлено не было (p >0,1). Предиктивная модель продемонстрировала высокую диагностическую ценность (AUC ROC=0,781; p=0,021).

Заключение. КГП обладает избирательной клинической пользой у пациентов с распространёнными солидными опухолями. Разработанная предиктивная модель позволяет идентифицировать больных, наиболее вероятно выигрывающих от КГП, что важно для рационального использования ресурсов в онкологии.

Ключевые слова: комплексное геномное профилирование; метастатические солидные опухоли; молекулярно-направленная терапия; предиктивная модель.

Список литературы

  1. Miller KD, Nogueira L, Devasia T, et al. Cancer treatment and survivorship statistics, 2022. CA Cancer J Clin. 2022;72(5):409–436. doi: 3322/caac.21731 EDN: WFLXED
  2. National Cancer Institute. SEER Cancer Statistics Review 1975–2018 [Internet]. Available at: https://seer.cancer.gov/archive/csr/1975_2018/results_merged/sect_04_cause_spec_survival.pdf. Accessed: 21.01.2025.
  3. Mosele MF, Westphalen CB, Stenzinger A, et al. Recommendations for the use of next-generation sequencing (NGS) for patients with advanced cancer in 2024: a report from the ESMO Precision Medicine Working Group. Ann Oncol. 2024;35(7):
    588–606. doi: 1016/j.annonc.2024.04.005 Erratum in: Ann Oncol. 2025;36(4):472. doi: 10.1016/j.annonc.2024.11.010 EDN: BEMSHO
  4. Cifuentes C, Lombana M, Vargas H, et al.; ONCOL Group; CLICaP. Application of Comprehensive Genomic Profiling-Based Next-Generation Se-quencing Assay to Improve Cancer Care in a Developing Country. Cancer Control. 2023;30:
    10732748231175256. doi: 1177/10732748231175256 EDN: NIKHUY
  5. Hobbs BP, Pestana RC, Zabor EC, et al. Basket Trials: Review of Current Practice and Innovations for Future Trials. J Clin Oncol. 2022;40(30):3520– doi: 10.1200/JCO.21.02285 EDN: PBOOHA
  6. Pankiw M, Brezden–Masley C, Charames G. Comprehensive genomic profiling for oncological advancements by precision medicine. Med Oncol. 2024;41(1):1. doi: 1007/s12032-023-02228-x EDN: KMUWNV
  7. Teuwen L-A, Roets E, D’Hoore P, et al. Compre-hensive Genomic Profiling and Therapeutic Implications for Patients with Advanced Cancers: The Experience of an Academic Hospital. Diagnostics (Basel). 2023;13(9):1619. doi: 3390/diagnostics13091619 EDN: ECEPAW
  8. Tjota MY, Segal JP, Wang P. Clinical Utility and Benefits of Comprehensive Genomic Profiling in Cancer. J Appl Lab Med. 2024;9(1):76–91. doi: 1093/jalm/jfad091 EDN: XOWJIO
  9. Tredan O, Corset V, Wang Q. Routine molecular screening of advanced refractory cancer patients: An analysis of the first 2490 patients of the ProfiLER study. J Clin Oncol. 2017;35(18 Suppl): doi: 10.1200/JCO.2017.35.15_suppl.LBA100
  10. Tsimberidou A-M. Initiative for Molecular Profiling and Advanced Cancer Therapy and challenges in the implementation of precision medicine. Curr Probl Cancer. 2017;41(3):176–181. doi: 1016/j.currproblcancer.2017.02.002 EDN: YGSQFG
  11. Tsimberidou A-M, Hong DS, Wheler JJ, et al. Precision medicine: Clinical outcomes including long-term survival according to the pathway targeted and treatment period — The IMPACT study. J Clin Oncol. 2018;36(18 Suppl):LBA2553. doi: 1200/JCO.2018.36.18_suppl.LBA2553
  12. Tuxen IV, Rohrberg KS, Oestrup O, et al. Copenhagen Prospective Personalized Oncology (COPPO) — Clinical Utility of Using Molecular Profiling to Select Patients to Phase I Trials. Clin Cancer Res. 2019;25(4):1239–1247. doi: 1158/1078-0432.ccr-18-1780
  13. Wheler JJ, Janku F, Naing A, et al. Cancer Therapy Directed by Comprehensive Genomic Profiling: A Single Center Study. Cancer Res. 2016;76(13):3690–3701. doi: 1158/0008-5472.can-15-3043
  14. Joseph SE, Mathew A, Rajappa SJ, et al. Clinical relevance of comprehensive genomic profiling for advanced cancers in India. J Clin Oncol. 2021;39(15 Suppl):e18718. doi: 1200/JCO.2021.39.15_suppl.e18718 EDN: CXTDCB
  15. Mathew A, Joseph S, Boby J, et al. Clinical Benefit of Comprehensive Genomic Profiling for Advanced Cancers in India. JCO Glob Oncol. 2022;8:e2100421. doi: 10.1200/go.21.00421 EDN: LYJIJR
  16. Chen C, Lin C-J, Pei Y-C, et al. Comprehensive genomic profiling of breast cancers characterizes germline–somatic mutation interactions mediating therapeutic vulnerabilities. Cell Discov. 2023;9(1):125. doi: 1038/s41421-023-00614-3 EDN: EWVBJB
  17. Law JW, Bapat B, Sweetnam C, et al. Real-World Impact of Comprehensive Genomic Profiling on Biomarker Detection, Receipt of Therapy, and Clinical Outcomes in Advanced Non–Small Cell Lung Cancer. JCO Precis Oncol. 2024;8:e2400075. doi: 1200/po.24.00075 EDN: CCGEQJ
  18. Mori Y, Suzuki O, Tanabe N, et al. Clinical Outcomes of Patients with Colorectal Cancer Who Underwent Comprehensive Genomic Profiling: A Single-institution Non-comparative Prospective Observational Study. J Anus Rectum Colon. 2024;8(4):289–297. doi: 23922/jarc.2024-006 EDN: YETICM
  19. Ali SM, Sanford EM, Klempner SJ, et al. Prospective comprehensive genomic profiling of advanced gastric carcinoma cases reveals frequent clinically relevant genomic alterations and new routes for targeted therapies. 2015;20(5):499–507. doi: 10.1634/theoncologist.2014-0378 EDN: UONLTR
  20. Waddell N, Pajic M, Patch A-M, et al. Whole genomes redefine the mutational landscape of pancreatic cancer. Nature. 2015;518(7540):495–501. doi: 10.1038/nature14169  EDN: URBBNH

2025 год, выпуск №2
Оригинальное исследование
Читать статью (pdf) →
DOI: 10.23888/HMJ2025132191-207
Как цитировать:

Шило П.С., Макаркина М.Л., Хвастушин Н.С., Захаренко А.А. Клиническая польза от назначения комплексного геномного профилирования в смешанной когорте пациентов с распространенными солидными опухолями: предиктивная модель // Наука молодых (Eruditio Juvenium). 2025. Т. 13, № 2. С. 191–207. doi: 10.23888/HMJ2025132191-207  EDN: BEBZIH
Дополнительная информация:
Источники финансирования. Отсутствуют.
Раскрытие интересов. Авторы заявляют об отсутствии отношений, деятельности и интересов, связанных с третьими лицами (коммерческими и некоммерческими), интересы которых могут быть затронуты содержанием статьи.

Об авторах:
*Шило Полина Сергеевна, врач-онколог; eLibrary SPIN: 1723-6942; ORCID: 0009-0001-1482-4604; e-mail: polinashilo0@gmail.com
Макаркина Мария Леонидовна, канд. мед. наук, врач-онколог; ORCID: 0000-0001-5331-1206; e-mail: stepanova100992@mail.ru
Хвастушин Никита Сергеевич, ординатор; ORCID: 0009-0000-8529-0884; e-mail: nshvastushin@gmail.com
Захаренко Александр Анатольевич, д-р мед. наук, профессор, заведующий кафедрой онкологии факультета последипломного обучения; eLibrary SPIN: 3209-8677; ORCID: 0000-0002-8514-5377; e-mail: 9516183@mail.ru